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爲探究SARS的來龍去脈，各國科學家在發現新型冠狀病毒可能是主要罪魁之後，追溯到果子狸標本中的SARS病毒與人類SARS病毒有百分之九十九以上的同源性。基因分析則證明，動物SARS病毒是人類SARS病毒的前體。因此有人認爲，SARS是人畜共患的疾病。
對此，中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所人畜共患病研究專家尚德秋則認爲，目前只是初步從動物標本中獲得了SARS樣病毒，並沒有找到動物身上病毒與人類病毒之間的關聯性，下此結論還爲時過早。
中國疾病預防控制中心微生態學研究專家盧金星認爲，不能把果子狸的病毒與人類SARS病毒有百分之九十九的同源性作爲鎖定傳染源的根據。因爲，即使兩種微生物的同源性達到百分之百，也不一定是一個東西。而截至目前，既沒有證據表明果子狸身上的SARS樣病毒引發了此次人間疫情，也沒有證據表明果子狸因這一病毒而發病。
尚德秋說，醫學上所稱的人畜共患病的概念是，人和脊椎動物由共同的病原體引起的並在流行病學上有關聯的疾病。從果子狸標本中分離到的SARS樣病毒，並不等於SARS即是人畜共患病，也不等於果子狸就是傳染源。從果子狸中分離出的病毒從何而來？依然需要追蹤溯源。
針對分離到的三株SARS樣病毒的六隻果子狸來自同一市場，尚德秋提出這樣的疑問：這些果子狸是野生的還是飼養的？與人有沒有過接觸？與其它動物間有沒有過接觸？它們所攜帶的SARS樣病毒是其自身就有的還是被人或其它動物傳染而來？此外，果子狸感染SARS後有沒有導致病理損傷？有沒有病原體的排出？如果有，其毒力如何？
盧金星說，病原的比較與分析不僅要看同源性，也要看其基因讀碼框架。對於基因以不同次序讀碼，所得結果可能完全不同。如果僅從同源性看，人類基因組與豬的基因組的同源性也很大。現在還不能把從果子狸標本中分離到的SARS樣病毒稱爲病原體。因爲病原體意味着致病性。
他強調，從微生態學的角度出發，大千世界，只有相對的致病微生物，而沒有絕對的病原體。有些微生物在動物體內是安全的，進入人體內即可出現致病性。例如霍亂爲甲類傳染病，由霍亂弧菌引起。霍亂弧菌對人是一個強致病原，而對於螃蟹卻是無害的。引發腹瀉的O一五七菌株對人也有強致病性，而對於一些家畜卻只是“健康攜帶”。痢疾桿菌對人有強攻擊性，換了老鼠做宿主，卻會相安無事。
尚德秋指出，人畜共患病一般先要經過動物中的循環傳播，再由某種因素侵入人羣，而逐漸定居下來，有一個由動物逐步向人轉化的過程。在人畜共患病中，有些原本就是動物中流行的疾病，也有些則是先在人羣中發現，後又追蹤到動物。原本爲動物中流行的疾病而傳染給人的人畜共患病很多。其中萊姆病在人羣中的最初病例，就是人接觸染有萊姆病的野生動物，受到了其媒介昆蟲蟎和蜱的叮咬所致。烈性傳染病埃博拉出血熱，已知猿猴和黑猩猩是首例病人的傳染源。而研究也已經證明艾滋病是人畜共患病。
尚德秋提醒人們，如果證實SARS爲人畜共患疾病，將意味着疫情控制將更加艱難。這是因爲人畜共患疾病的控制不僅是對人，還要對有關的動物及其媒介昆蟲的設防。從某種意義上說來，人類抵禦來自動物尤其是家畜的病患威脅更爲不易。鼠疫、瘋牛病、結核病、流感、口蹄疫等許多人畜共患疾病，已經給人類造成了災難性危害。如若SARS人畜共患疾病的推測成立，人類與SARS的戰鬥無疑將需要採取新的作戰方略。
中國疾控中心病毒研究所畢勝利研究員認爲，SARS病毒可能是一個非常保守的病毒，早已存在。研究結果表明，SARS有百分之二十的隱性感染率，即攜帶病毒，從抗體可以查出來。因此該病毒既可能是野生動物攜帶的，也可能是人類踏入其生態圈造成的，這需要科研工作者做更細緻的長期艱苦工作。
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