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瞞報加重藥害
在收到廣西、上海3家醫院的不良反應檢測報告後，國家藥監局於2007年7月7日通知，暫停銷售使用華聯兩個批次的注射用甲氨蝶呤。
據悉，當時上海市藥監局局長在京，他意識到不能隱瞞，馬上請求國家局介入調查。
國家藥監局的調查專家3次趕赴上海，一次比一次人多。然而，一開始調查陷入了僵局。專家根據中國、美國和歐洲藥典，都沒法分析藥害原因。有一次討論會上，連甲氨蝶呤的用量都作為分析對象。有專家認為目前大部分醫院注射用量已超出說明書界定的規格，但另一部分專家則認為，以前也是如此做法，但並沒有這種藥害事件。
華聯一些管理和技術乾部被列入調查對象。然而，調查人員仍無法打開缺口。
事發之前，華聯負責人恰好更迭。『問現在的負責人，說剛來，不知道情況；問以前的，也說不知道。』一名藥監官員說，『很多人的問話都很一致，故意隱瞞了事實。』
上藥集團屬於中央企業，由上海市國資委代管。後來，北京調查人員幾次選擇了獨立問訊，上海人員不參與。而隨著調查難度加大，調查人員請求公安機關介入。
在調查期間，上海市藥監局還收到了舉報信，提醒調查人員不要過分相信問訊所得到的信息，要仔細調查。
在這場掩飾真相的博弈中，作為上市公司，上藥集團數次發布公告，稱：『經我廠反復檢驗，上述4個批號產品的質量沒有發現異常。』
2007年8月2日，上海藥監局發文通知，解除了除第一次被禁批次以外的其它注射用甲氨蝶呤登記，重新允許醫院使用。
然而，約一個月時間後，國家藥監局連續兩次發布通知，暫停所有華聯產的甲氨蝶呤用於鞘內注射，揭示著背後的調查已經有了新突破。這一次，阿糖胞?同樣被列入暫停注射使用名單。
但由於這一『有組織地隱瞞』，就在國家藥監局調查期間，更多的白血病人繼續受害。
去年8月，吳曦在上海藥監局解禁甲氨蝶呤的幾天後，非常不幸地改用了阿糖胞?注射，幾個月後下肢癱瘓，大小便失禁。『我們是最不應該受害的，為什麼當時不早點公布真相呢？』父親吳建華責問。
26歲的小陸在7月24日注射了阿糖胞?後，出現相似不良反應。『當時已經有好幾個病人都這樣，全都是阿糖胞?。如果真相沒有被蒙蔽，我們也不會這樣啊。』小陸說。
真相水落石出
去年9月14日，衛生部、國家藥監局聯合發布調查結果。這兩種藥物造成的藥害事件，是因為部分批次產品中混入了微量硫酸長春新鹼——另一種不能用於鞘內注射的抗腫瘤藥物。
在2007年12月的新聞發布會上，國家局新聞發言人強調：『在衛生部、國家藥監局聯合調查組的前期調查中，以及上海市公安部門的後期偵查當中，華聯的有關負責人有組織地隱瞞了違規生產的事實。』
據悉，在是否公布華聯隱瞞事實的細節上，中央和地方曾有分歧。但此事已啟動一級預警方案，中央是統一的信息發布部門。
藥監部門調查結束後，此案已轉由上海市公安局負責。但它對醫藥系統的影響深遠。在一次多家藥廠負責人參與的總結會議上，一名藥監官員怒聲責問：『你們捫心自問，你們的生產質量未必比得上華聯！』『這是嚴重的質量管理混亂。』一名外地的藥監官員聽聞此事後說。在調查結果列舉的5條違規行為中，藥廠甚至沒有將尾料交由三廢處理人員，而是由灌裝工收集存放於儲藏室，繼續用於生產。
為什麼在出廠時無法檢測出問題呢？這名藥監官員認為，按照目前國內的檢測手段，一般只檢測甲氨蝶呤的濃度含量，無法針對性地分析其餘成分。
這個問題也反映在事後調查過程中。專家的調查歷時近兩個月仍未能發現原因。後來一名技術官員在與跨學科的醫學專家交流時，談及藥害癥狀為何極像長春新鹼的不良反應，這纔指向了最終真相。
據報道，華聯幾種抗腫瘤藥物是使用同一條生產線。這在業內是被認可的生產流程。『按照藥監管理規定，生產線上藥物更換有一個很重要環節：清場，把各種管道的殘渣清理乾淨後纔能上另一種藥。』上述官員說。
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