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許多專家已有大哥大電磁波對人體造成失眠、心悸、內分泌失調、記憶力減退等個案報告；世界衛生組織（WHO）一九九六年即公佈大哥大基地臺設置標準建議，認爲基地臺二十呎（約六公尺）內，須設置柵欄不讓人靠近，高度則應至少距地面五十呎（約十五層樓高）。 臺灣陽明大學放射醫學科學研究所曾進行島內大哥大基地臺輸出功率的測量，雖然測量結果發現，臺灣最常使用的九百及一千八百兩種功率的大哥大基地臺的輸出功率，並未超過美國國家規範的每平方公分零點六及一點二毫瓦特標準；但學者認爲，美國的基地臺多設在地廣人稀的郊區，而國內人口稠密、且基地臺又普設在住宅區，規範應比美國更嚴格。 大哥大電磁波屬於與高壓電、雷達站、核磁共震發出的電波都屬於“非遊離輻射”，不如“遊離輻射”有致癌危險；但“非遊離輻射”對身體會產生“熱效應”，若輻射量很大，會使眼睛的水晶體混濁，容易發生白內障；而男性睪丸長期曝露在其中，精蟲也會被“熱死”，造成不孕。國外也研究發現，若癌患接觸大量”非遊離輻射”，癌細胞可能受電磁波刺激，增生得較快。 此外，國外已有關於長期處於電磁波輻射下，導致失眠、心悸、內分泌失調、血液循環失調、記憶力減退等個案報告出現。臺大醫院研究也發現，二至十瓦特功率的手提式大哥大，若距離使用心律調節器者五公分內，5%的心律調節器會遭干擾，無法正常運作，一旦發生在對心律調節器高度依賴的患者身上，有因心臟暫停跳動、昏厥的危險。 大哥大基地臺紛紛進駐住宅區，使不少民衆憂心不已。國外研究顯示，大哥大基地臺發出的電磁波，對水平面的影響大於垂直的影響，因此，隔壁樓層的住戶的影響，反而較同一棟樓的住戶還大。
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