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在兩會上，很多代表委員認爲，農村縣、鄉、村三級預防保健體系的建設仍存在諸多問題，農村公衛服務體系亟待加強。
人大代表、遼寧省副省長滕衛平認爲，2003年和2004年，遼寧省在公共衛生上共投入10億元，是建國以來投入最多的一年，今年還有部分資金會陸續到位。應該說，縣級公共衛生的基礎設施建設和設備已經到位。現在擔心的是功能能否到位？他希望今年把工作重點放在功能上。功能建設既不要缺位，也不要越位，而應嚴格按照衛生部公佈的各級機構應承擔的功能來建設。
功能能否到位關鍵取決於人才。在資金和設備即將到位的情況下，農村公共衛生人才的問題越顯突出。目前的這支公共衛生隊伍不能適應功能的需要。遼寧省的縣級疾病預防控制中心僅有30%達到國家要求的功能標準。希望國家儘快建立符合社會主義市場經濟規律的農村公共衛生人才培養和流動機制。
河南省衛生廳新近對該省1971所鄉鎮衛生院的調查顯示，1/6鄉鎮衛生院已經或基本倒閉，1/2勉力維持，只有1/3能正常運轉。鄭州大學二附院楊利霞委員呼籲，農村三級預防保健網不能再“線斷網破”了！
楊利霞委員認爲，造成這一現象的主要原因在於，衛生經費嚴重缺乏並未好轉，甚至有些地方的差額補貼比例反而降低了。而經費不足背後的原因很大程度上源於管理體制不順。河南的數據表明，鄉鎮衛生院實行縣鄉共管或鄉管的，通常財政投入不足，內部管理混亂。
她說，由於本應屬於政府財政確保的疾病控制、衛生監督、婦幼保健和健康教育等公衛投入嚴重不足，迫使一些防疫站、保健站把主要精力放在門診、住院等有償服務的開展，靠創收來彌補經費的不足，從而導致一些傳染病得不到有效控制。另外，衛生監督工作不力，衛生執法覆蓋不夠全面，特別是對疾病控制、公共衛生和醫療行爲的監督十分薄弱也是問題的癥結之一。
她提出，農村公共衛生屬於基本的公共產品，應建立和完善農村衛生專項轉移支付制度，將農村基本衛生服務列入公共財政支出範圍，進一步加大財政投入力度。新修訂的《傳染病防治法》就明確規定要保障疾控工作和應急處理工作的經費全額列入預算安排。建議農村公衛所需經費由縣級財政安排，對十分困難的縣、鄉由市、省財政撥付。
浙江省人民對外友好協會副會長徐鴻道委員說，實踐證明，建立並完善縣、鄉、村三級疾病預防保健網是適合我國國情的農村公衛體系，而建立健全這一網絡就應該實行垂直管理、逐級負責，由縣對農村公衛工作承擔全面責任。
在具體操作層面，徐鴻道委員認爲有幾種思路可以借鑑。一個是分離鄉鎮衛生院職能，將預防保健職能剝離出來，成立鄉鎮預防保健所，定性爲全額撥款的事業單位，人員與經費列入縣級預算，實行“縣鄉共管、以縣爲主”的垂直業務指導管理體制。另一種思路是政府購買公衛服務，把鄉鎮衛生院定位爲以公衛爲主，集預防、保健、健康教育、醫療、康復、計劃生育指導於一體的社區服務機構，並按一定比例配備公衛人員，根據定期考覈結果發放財政資金。
對於村級衛生保健服務工作，應推進鄉、村衛生機構改革，強化鄉、村醫療機構的預防保健、基本醫療等一體化管理，真正落實鄉鎮衛生院對村衛生室的指導與監管作用，實現統一佈局設置、人員配備、財務管理、勞務分配、藥品管理的“五統一”。明確鄉村醫生的報酬和身份，充分調動其一體化管理的積極性和主動性。
徐鴻道委員強調，加強農村預防保健隊伍建設，開發、配置適宜的農村疾病預防控制人才，充實和優化衛生人力資源結構也必不可少。
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