英國政府一個監察組織說，水療可能會嚴重影響身體健康。英國健康保護署說，沒有嚴格的清潔和消毒程序的話，水療池或浴缸可能藏有可致病甚至致命的病菌。
據介紹，最大的威脅來自軍團病，這種疾病可導致嚴重呼吸困難。過去五年已有五宗與水療池有關的軍團病報告，導致四人死亡。類以流感的龐蒂亞克熱病亦是一個威脅。
英國健康保護署編撰了一本124頁厚的水療池安全指引，當中的發現令人懮慮。其它危險包括水中含有可能導致致命腦膜炎的奈格式阿米巴變型蟲，亦可能滋生可引致角膜炎的棘阿米巴變型蟲。
水療浴池沒有經過定時消毒，將有病毒和隱孢子蟲存活。後者是一種病原體，能導致嚴重不適和胃痛。
專家建議浴池使用者：保持頭發不沾水，及避免吞下浴池的水。水療池之所以容易受感染，是因為使用者都擠在一個細小的范圍內，肯定令水有高濃度的有機物質，例如鼻子裡的粘液、口水、汗水、死皮、防曬油、化妝品、洗發水或肥皂、毛發，大小便等。
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