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衛生部常務副部長高強4日向十屆全國人大常委會第八次會議報告建立健全突發公共衛生事件應急機制工作情況時說，造成非典疫情早期流行和蔓延的主要原因是我國公共衛生體系存在缺陷，有效應對突發公共衛生事件的機制不健全，處理和管理危機能力不強，缺乏應對突發事件的必要準備。
高強說，公共衛生體系的缺陷主要表現在以下五個方面：
缺乏統一的應急指揮系統。醫療衛生資源條塊分割，有效的信息溝通與協調機制不健全，有的地方政府不能統一協調指揮，難以有效整合資源；
缺乏有效應對突發公共衛生事件的應急預案。應對突發公共衛生事件的職責和任務不明確，監測預警制度不健全，應急設施設備不完善，應急救治藥品器械和物資儲備不充足，有的地方一度處於被動局面；
重大傳染病疫情信息報告網絡不健全。疫情報告缺乏順暢渠道，執行疫情的收集、分析、報告和通報制度不嚴格，政府及有關部門難以及時準確地掌握疫情；
應急醫療救治能力不強。相當多的醫療機構不具備應急處置的必要設施，醫務人員缺乏應急意識和防護知識，不能有效地實施預防控制和醫療救治；
疾病預防控制體系薄弱。各級疾病預防控制機構存在人員素質不高、設施條件落後的情況，職能不明確，工作效率低。
高強說，這些問題導致突發公共衛生事件發生時，不能有效應對，及時控制，造成疫情的傳播和擴散，不僅給人民身體健康帶來了嚴重威脅，也對經濟發展和社會穩定產生了重大影響。
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