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從理論上看,異基因移植可能更爲有效,這是因爲①可破壞清除所有自身免疫T淋巴細胞克隆和記憶細胞;②回輸的幹細胞源於健康供者,不會混入患者自身的自反應免疫細胞;③移植物可產生移植物抗自身免疫效應。以異基因移植治療合併免疫病的造血系統惡性疾患,移植後大多數患者並存的免疫病可獲得完全緩解。但是異基因移植相關死亡率高,在血液系統疾病中致殘率和死亡率達到15%~30%,遠高於自體移植(小於5%);移植後可以出現慢性移植物抗宿主病,臨牀表現類似免疫病,降低患者存活質量;而且即使在異基因移植後表現爲完全的供者型造血嵌合體,也並非均能治癒疾病。由於在自身免疫病中,治療的目標主要是減少死亡率、致殘率,改善患者的生活質量,目前異基因移植在自身免疫病中的應用極少。
與異基因移植相比,自體幹細胞移植優點是不需要尋找供者、安全性高、移植後患者生活質量高、治療費用低,其最大的缺點則是疾病複發率高。
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